Premier stade
Les premiers symptômes sont non spécifiques : fièvre, maux de tête, fatigue, démangeaisons et douleurs articulaires. À ce stade, la maladie est facile à traiter, mais difficile à diagnostiquer. Sans traitement, le parasite atteint le système nerveux central, marquant le passage au second stade.
Deuxième stade
Apparition de troubles neurologiques graves : mauvaise coordination, confusion, agitation, agressivité, désinhibition. Le nom de « maladie du sommeil » provient d’un trouble du sommeil : difficulté à dormir la nuit compensée par une somnolence diurne. Sans traitement, la maladie est mortelle.